转座子(Transposable Element,TE)是基因中可运动的DNA元器件。麦子族种群的转座子展现爆发式提高,基因达到3-16 Gb,85%之上由TE构成,而与之亲缘关系紧密的二穗细柄草基因仅有272 Mb。可以说麦子的遗传基因是“撒落”在TE的大海中,那麼这种TE人群只是是自身拷贝废弃物编码序列,依然会危害寄主的遗传基因活力与适应能力呢?
中科院基因遗传与发育生物学研究室研究者薛勇彪课题组、复旦研究者张一婧课题组与中国科学院分子结构绿色植物科学研究非凡创新中心/上海市绿色植物挫折分子生物学研究所研究者朗曌博课题组和南京农大专家教授刘文利课题组运用DNA亲和力提纯转录组测序(DAP-seq)技术性得到53个自然环境回应转录因子的全基因高品质融合图普(图A),发觉达到85%转录因子融合结构域(Transcription Factor Binding Sites,TFBS)坐落于TE內部(TE-embedded TFBS)。根据与TE內部TFBS较为,研究发现1/4非TE区TFBS(nonTE-TFBS)很有可能来自TE-embedded TFBS,而且是麦子族特异性发生的管控编码序列,进一步适用这种非TE管控区是随着麦子族TE暴发发源的。TE-embedded TFBS和TE来源于TFBS(TE-derived TFB)关键由好多个特殊LTR反转录转座子亚大家族奉献,表明这几种TE亚大家族的重复和转座非特异参加了麦子的遗传基因管控互联网。伴随着TE-derived TFBS编码序列与TE编码序列分裂時间越长,其活力越高,与遗传基因的间距也越近,因此,TE有可能为TFBS演变给予了普遍的编码序列基本(图B)。除此之外,根据与稻谷挫折回应遗传基因较为发觉,麦子非特异挫折回应遗传基因明显聚集在TE-derived TFBS的靶遗传基因中,表明麦子非特异的TE亚大家族参加了麦子基因表达管控互联网的重构及麦子的适应能力演变(图C)。
有关研究结论于9月9日线上发布在Genome Research上。科学研究工作中获得自然科学基金杰出青年科学研究国家社科基金和中国科学院战略主导高新科技重点的支助。
麦子特异性转座子重构麦子自然环境适用的管控互联网