2.5 冷激蛋白质的结构特征

为更强掌握冷激蛋白质潜在性的微生物作用，剖析其蛋白质的空间布局。将海产品腐坏希瓦氏菌冷激蛋白质的碳水化合物编码序列递交到PSＩPRED预测分析其二级结构，結果见图4。典型性的冷激蛋白质的二级结构包括五个β伸缩，预测分析获得的二级结构与这一結果大概相符合，Csp1589和Csp1376二级结构的最后一个β伸缩发生断块，这可能是天冬酰胺预测分析真实度太低而致。

将冷激蛋白质的氨基酸序列递交SWＩSS-MODEL网址，依据编码序列相似度及实体模型品质各自选择1mjc的A链、5xv9的A链、3i2z的B链做为Csp1589、Csp1376和Csp2252的模版模型。随后，用PROCHECK和verify3D对所建三级实体模型开展品质评定。搭建的腐坏希瓦氏菌冷激蛋白质三级构造都包括五个反方向平行面的β链，其产生了一个桶状构造，合乎冷激蛋白质的已经知道特点。由拉氏构像图可看得出，针对Csp1589蛋白质实体模型，碳水化合物处在有益地区、附加容许地区、一般容许地区及其不允许地区的量分別为88.9%，11.1%，0%和0%。针对Csp1376型蛋白质实体模型，相匹配值各自为92.7%，7.3%，0.0%和0.0%。针对Csp2252型蛋白质实体模型，相匹配值各自为96.1%，3.9%，0.0%和0.0%，碳水化合物所有处在有益地区和附加容许地区，实体模型品质不错。在Ｖerify3D結果中，针对Csp1589、Csp1376和Csp2252实体模型，均分≥0.2的碳水化合物的量分别是和100%，89.86%和100%，均分≥0.2的碳水化合物的量做到80%就觉得蛋白质三级实体模型是符合标准的，因而，以verify3D結果看来，这3个实体模型均具备不错的品质。

2.6 冷激蛋白质的互作蛋白质及配位融合结构域剖析

运用STRＩNG和COACH网址对腐坏希瓦氏菌冷激蛋白质开展剖析，获得如图所示6所显示与其说密切功效的蛋白和不确定性的配位融合结构域。针对腐坏希瓦氏菌冷激蛋白质Csp1589、Csp1376和Csp2252，STRＩNG各自检验到5，4，10个与其说相互影响的蛋白质（图6）。与冷激蛋白质Csp1589存有相互影响的蛋白质是组氨酸蛋白激酶（ABP76854.1）、甲谷丙转氨酶（ABP75296.1）、DNA聚合酶1（polA）、多用途融合蛋白（trpC）、伴侣蛋白（htpG）。与冷激蛋白质Csp1376存有相互影响的蛋白质是组氨酸蛋白激酶（ABP76854.1）、DNA聚合酶1（polA）、多用途融合蛋白（trpC）、伴侣蛋白（htpG）。与冷激蛋白质Csp2252存有相互影响的蛋白质是依靠ATP的Clp胰蛋白酶（ABP75948.1）、依靠ATP的Clp胰蛋白酶兼容蛋白质（ClpS）、组氨酸蛋白激酶（ABP76854.1）、DNA聚合酶1（polA）、多用途融合蛋白（trpC）、组氨酸硫酸铵氨谷丙转氨酶（hisC）、硫酸铵庚糖异构酶（gmhA）、带有CBS结构域的蛋白质（ABP76571.1）、氮管控蛋白质PtsN（ABP74443.1）、伴侣蛋白（htpG）。在其中组氨酸蛋白激酶是一个磷酸化组氨酸传统残基的讯号传输酶大家族，参加组成组份数据信号传输系统软件。组份数据信号传输系统软件能够磁感应环境破坏，解决环境破坏造成的负面影响，研究表明一些组份信号转导系统软件参加了病菌的超低温融入全过程，推断腐坏希瓦氏菌冷激蛋白质与体细胞对挫折的融入相关。DNA聚合酶是DNA复制的关键酶，冷激蛋白质很有可能与DNA复制相关。冷激蛋白质做为一种伴侣蛋白，很有可能与伴侣蛋白htpG存有竞争关系。从研究结果显示可推断相比Csp1589和Csp1376，腐坏希瓦氏菌冷激蛋白质Csp2252的作用很有可能更加繁杂。在很多主要的生命活动中，蛋白质功能的实行取决于蛋白与配位的相互影响，针对蛋白配位融合结构域的预测分析具备关键的实际意义。比如：把小分子水放进目地蛋白质的配位融合结构域，提升配位构像和部位，使之和目地蛋白质有最好的融合功效，就会有很有可能发觉抑止该蛋白质的化学物质。针对腐坏希瓦氏菌冷激蛋白质Csp1589、Csp1376和Csp2252，其各自预测分析到2，2，一个概率较高的配位融合结构域（图6）。

3 结果

冷激蛋白质是分析病菌超低温融入的重要蛋白质之一。本科学研究取得成功增加了海产品腐坏希瓦氏菌的3个冷激蛋白质遗传基因，并对其开展生物信息学剖析，得到蛋白质理化性质、构造和作用领域的有关进度。腐坏希瓦氏菌冷激蛋白质均为亲水性的小分子水酸碱性蛋白，皆坐落于细胞核，为非代谢型、非跨膜蛋白，都存有冷激蛋白质独有的冷休克结构域，存有DNA融合结构域和RNA融合基序（motif），能与单链DNA和单链RNA融合。腐坏希瓦氏菌冷激蛋白质Csp1589和Csp1376与大肠埃希菌冷激蛋白质CspA亲缘关系较近，很有可能在腐坏希瓦氏菌超低温融入全过程中起主要功效。冷激蛋白质的二级结构和三级构造均合乎冷激蛋白质大家族的特点，其靠谱的三级实体模型可用作各种各样连接和药品靶向治疗科学研究。根据蛋白质互作和配位融合结构域的剖析，对其作用有深入的掌握，为事后认证冷激蛋白质在腐坏希瓦氏菌超低温融入全过程中的作用，及其海产品中腐坏希瓦氏菌冷激蛋白质缓聚剂的挑选打下基础。