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发酵冬瓜对感染金黄色葡萄球菌小鼠肠道菌群的调节作用(二)

来源:郑州天顺食品添加剂有限公司 发布时间:2023-04-27 14:14:10 关注: 0 次
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2.1.2 菌群的结构组成

SW组与CT组相比,雌性小鼠的厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)相对丰度由61.09%和76.73%下降到48.35%和2.92%,拟杆菌门(Bacteroidetes)的相对丰度由28.02%增加到46.03%。SA组与CT组相比,雄性小鼠厚壁菌门相对丰度由57.01%上升到80.20%,拟杆菌门和变形菌门的相对丰度由26.78%和14.33%下降到13.21%和3.20%,雌性小鼠变形菌门的相对丰度也下降,从7.67%下降至4.76%。SA+SW组与CT组相比,雄性小鼠厚壁菌门相对丰度由57.01%上升到67.18%,变形菌门的相对丰度由14.33%下降4.84%,雌性小鼠厚壁菌门相对丰度由61.09%下降至44.59%,拟杆菌门相对丰度由28.02%上升到42.06%(图3)。

与CT组比较,雌性小鼠与雄性小鼠的SW组乳酸杆菌属相对丰度分别从32.51%和44.34%下降到7.56%和6.86%,SA组乳酸杆菌属也下降至15.68%和11.02%,而SA+SW组乳酸杆菌属相对丰度回升至25.30%和39.16%。雄性小鼠的梭菌属、Anaerocolumnasp.和罗斯氏菌属相对丰度在SW组分别由1.51%、0.96%和0.14%上升至6.34%、4.02%和3.61%,在SA组中分别上升至12.81%、5.34%和4.11%,SA+SW组相比SW组和SA组有下降趋势。雌性小鼠的梭菌属与雄性小鼠的变化趋势一致,SW组与SA组梭菌属相对丰度分别由3.27%增加到7.60%和3.44%,而SA+SW组中的梭菌属相对丰度下降到2.92%。此外无论雌性还是雄性小鼠,拟杆菌属在SW组和SA组下降,而在SA+SW组又趋于上升(图4)。

与CT组比较,雄性小鼠SW组的约氏乳杆菌(Lactobacillusjohnsonii)、动物乳杆菌(Lactobacillusanimalis)和罗伊氏乳杆菌(Lactobacillusreuteri)三种菌相对丰度分别从19.56%、17.59%、6.03%降低至0.79%、4.54%和1.3%,在SA组中分别降低至0.49%、9.21%、1.03%,而这三种菌在SA+SW组中与SA组相比相对丰度升高,其中动物乳杆菌升高至25.31%。与对照组相比,SW组的Muribaculumintestinale丰度从17.24%增加到25.49%,而SA组Muribaculumintestinale丰度从17.24%降至8.33%。Kineothrixalysoides、解糖梭菌(Clostridiumsaccharolyticum)在SA组相对丰度比其他组高。在雌性小鼠中,与CT组比较,SW组和SA组中的动物乳杆菌分别从21.77%下降至4.07%和16.58%,在SA+SW组中回升至28.53%;SW组、SA组、SA+SW组中Muribaculumintestinale相对丰度分别从11.29%上升至30.91%、29.43%和14.26%(图5)。

2.1.3 LEfSe菌群差异分析

基于小鼠肠道菌群进行了LefSe(LDAEffectSize)差异性分析(LDAScore>3),找到了不同组间在丰度上有明显差异性的物种(biomarker)。在雄性小鼠中,与CT组相比,SW组厚壁菌门中的Kineothrixalysoides、肠道罗斯拜瑞氏菌(Roseburiaintestinalis)和Clostridiumoryzae菌明显增加,在SA组中厚壁菌门中的Faecalicatenaorotica、化糖梭状芽孢桿菌(Clostridiumsaccharolyticum)和帕氏乳杆菌(Lachnoclostridiumpacaense)菌的丰度较高,而在SA+SW组中厚壁菌门中的血尿杆菌(Turicibactersanguinis)和变形菌门中的脱硫芽孢弧菌(Desulfovibriodesulfuricans)丰度较高(图6A);在雌性小鼠中SW组Prevotellamassiliatimonensis、ParabacteroidesdistasonisATCC8503、Parabacteroidesmerdae、Clostridiumpolysaccharolyticum的丰度较高,SA组中化糖梭状芽孢桿菌、Anaerocolumnajejuensis和帕氏乳杆菌菌丰度较高,而在SA+SW组中丰度较高的菌种则为血尿杆菌和脱硫芽孢弧菌。与CT相比,雌性小鼠喂食SW组中,Prevotellamassiliatimonensis、ParabacteroidesdistasonisATCC8503、Parabacteroidesmerdae和Longibaculummuris菌的丰度较高,SA组中只有Prevotellashahii菌丰度较高,而SA+SW组中血尿杆菌和脱硫芽孢弧菌丰度较高(图6B)。

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