近日，植物保护研究室食用菌菌种调研室在Journal of Fungi（IF=5.81）上刊登了题写“Haplotype-Resolved Genome Analyses Reveal Genetically Distinct Nuclei within a Commercial Cultivar of Lentinula edodes”的科学研究毕业论文，该科学研究根据HiFi[[[ ]]]Hi-C搭建了平菇2个单倍型核的高品质参照基因，分析了2个单核心体间的基因遗传差别并深入分析了这种差距在平菇生命期中的主要功效，进而为平菇不一样种类间基因遗传差别、后代基因重新组合等科学研究带来了新看法。

　　平菇（Lentinula edodes）是亚洲地区最受大家喜爱食用菌菌种种类之一，含有各种营养物质和药用价值特点，具备较高的营养价值和经济价值。在平菇绝大多数的生命期中，单独真菌体细胞中带有2个单倍体细胞质，共享资源一套细胞核管理体系，且不开展核结合；仅在转化成胞子时重担中的2个细胞质产生结合及减数分裂全过程，接着产生单倍体的胞子；平菇中仅有双核处理器体真菌才可以纽结产生原基并长成子实体。平菇不一样配种型单核心体基因的分析，针对揭露平菇2个细胞质在儿童生长发育中的基本功能和两核中间的相互影响及为必要性。

　　此项科学研究根据HiFi转录组测序和Hi-C輔助拼装，搭建了至今最完全的平菇单倍型基因。在其中SP3拼装的基因尺寸为50.83Mb，contig N50=3.4Mb，并将99.63%的编码序列定量化到10条性染色体上；SP30拼装的基因尺寸为49.80Mb，contig N50=2.64Mb，并将98.91%的编码序列定量化到10条性染色体上，BUSCO评定基因一致性各自为96.4%和96.2%。在这个基础上，较为了2株平菇单倍型基因与其他已发布的4株平菇株系基因的共线性，评定到了不一样平菇株系间的一共有和特有遗传基因。每一个平菇株系的特有遗传基因均在1000个上下，这种一共有遗传基因关键聚集在新陈代谢和体细胞成份有关的通道中。除此之外，运用共线性剖析可以了SP3和SP30基因间的性染色体重新排列及其重新排列遗传基因的作用差别，发觉2个核基因组序列差别超过30%，填补了对平菇不一样配种型基因差别的认知能力：SP3中评定到333个特有遗传基因，关键分布范围在9号性染色体上；SP30中评定到366个特有遗传基因，关键分布范围在1、2、3号性染色体上。最终，学者对SP3和SP30基因中的两种非连锁加盟配种型结构域A（matA）和B（matB）开展了精准定位科学研究，发觉SP3和SP30中matA的间距和基因结构层面出现差别，而二者间的matB在数目和部位上具有差别，为平菇定项杂交育种给予研究基础。该分析为进一步科学研究平菇种植品种间、栽培品种与野生植物种类间的关联，及其2个细胞质对平菇子实体产生的协作管控功效确立了基本。

　　植物保护研究室高琪助理研究员因此科学研究的第一作者，寒冬副研究员和澳大利亚麦克马斯特高校徐建平专家教授为本分析的通讯作者，此科学研究遭受了北京农业和林业研究院（BAAFS）、当代特色农业技术性管理体系北京食用菌菌种自主创新精英团队（BAIC05-2022）、我国食用菌菌种产业链技术性管理体系（CARS-20）等工程的支助。