近日,牛基因遗传繁育自主创新精英团队根据全基因组重测序数据信息,融合挑选数据信号、单特性相关性分析及其多特性相关性分析,发觉了与玉体特性有关的挑选数据信号及备选遗传基因,揭露了肉羊玉体特性的基因遗传体制,为肉羊玉体特性的培育确立了理论基础。有关成效发布在《Genomics(基因组学)》。
玉体特性做为肉羊关键经济发展特性之一,立即影响了鸡肉的产销量和品质,是肉羊繁育中的重要总体目标。分析肉羊玉体特性的基因遗传体制与原理并挖掘出有关的备选标识与遗传基因,不但可以为肉羊玉体特性的培育给予有关理论基础,还能够促进肉羊繁育进度,进一步地提升在我国牛羊肉生产量。现阶段,世界各国已很多进行了对肉羊玉体特性基因遗传基本分析工作中,捕获到 NCAPG 、 LCORL 等关键备选遗传基因,但运用全基因组重测序数据信息对玉体特性基因遗传体制分析的统计分析方法仍需自主创新。
图 肉羊玉体特性的多性状关系与挑选数据信号融合剖析
科学研究工作人员最先选用全基因的复合型似然比的方式(CLR)对44头昏脑胀转录组测序肉用西门塔尔牛进行了挑选数字信号处理,共发觉11600个挑选数据信号,捕获潜在性受挑选遗传基因2214个,聚集到18分子结构作用、69生物体全过程及其23个体细胞成分,涉及到了蛋清融合、血液循环系统等关键生物体全过程。次之,运用添充的全基因组重测序数据信息,对1233头肉用西门塔尔牛的玉体重、净肉重和屠宰率等特性开展单特性相关性分析,共发掘66个备选结构域,注解到 NCAPG 、 DCAF16 、 LCORL 等与玉体特性明显关系的备选遗传基因。接着,对该四个特性开展多特性相关性分析,各自在明显阀值和揭露阀值水准各自发觉109和1242个备选结构域,并各自注解到7和34个备选遗传基因,在其中 NCAPG 、 LCORL 等遗传基因再度捕获,与此同时还各自在遗传基因 NCAPG 和 TEX2 中看到了传统性较高的错义突变。最终,将玉体特性相关性分析与挑选信息的效果融合后,共发觉了88个重合区段,包含了27个备选遗传基因,这种遗传基因在受挑选的一起还与玉体和生长发育特性明显有关。科学研究从人群细胞生物学及其单特性和多性状相关性分析的视角,证实了肉羊玉体特性的多遗传基因构造,并为肉羊繁杂特性的基因遗传基本给予了新的基本思路。
该科学研究获得我国肉羊野牦牛产业链技术性管理体系、自然科学基金新项目、院自主创新工程项目重要科研任务的支助。
全文连接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34314829/