羧甲基纤维素为了提高水媒法的纯度和质量，可增加精制工序，水媒法羧甲基纤维素粗品的精制技术主要有硫酸洗涤精制法和甲醇水溶液洗涤精制法两种。
甲醇水溶液精制法是将羧甲基纤维素粗品用70%-80%甲醇水溶液在室温条件下洗涤，液体和固体的比例在10-15之间，洗涤次数要根据选择产品的档次而定，操作方法与溶媒法生产羧甲基纤维素的精制相同。硫酸酸洗精制法是将水媒法反应得到的羧甲基纤维素粗制品用一定浓度的硫酸水溶液浸渍，将水可溶性的羧甲基纤维素转变为水不溶的酸性H-羧甲基纤维素，除去多余废液后用清水充分洗涤，除去其中的盐等杂质。然后用碳酸钠中和，将H-羧甲基纤维素重新还原成羧甲基纤维素。