近日,中国水产科学院生物科技研究所在鲤抵御嗜水汽单胞菌感柒的分子结构体制领域获得重大进展,有关探讨毕业论文“Genomic features of common carp that are relevant for resistance against Aeromonas hydrophila infection”发布于水产品类1区杂志期刊《Aquaculture》(2020年JCR1区,IF=4.242)。该毕业论文获得我国要点科研开发方案(2018YFD0900102)和中国水产科学院中央级服务性科研单位基本上科学研究业务费项目资金(2018B003和2020TD24)支助。江炎亮副研究员为论文的第一及通讯作者,许建研究者为一同通讯作者。文章内容连接网站地址:https://authors.elsevier.com/sd/article/S0044-8486(21)01175-3.
嗜水汽单胞菌是鲤鱼养殖中伤害最明显的病原菌之一。科学研究员工对传染源和抵抗的鲫鱼开展全基因重转录组测序并进行全基因相关性分析,精准定位到八个与抗病性特性明显关系的SNP结构域(图1),并进一步寻找6个潜在性重要遗传基因,均为免疫力有关遗传基因:rab26,dcc,trim71,ptpn21,muc5b,trim25。八个明显关系的SNP中,有一个为非同义词SNP,坐落于遗传基因trim25的外显子地区,可引起Trim25蛋白质二级结构的更改(图2),且该遗传基因在经嗜水汽单胞菌感柒后的鲫鱼肝脏中明显上涨表述。科学研究结果显示鲤在基因水准上的遗传性差别影响了其抵御细菌感染的功能高低,为全基因培育鲤抗病性新品种给予了必不可少的分子结构基本。
图1. Manhattan 結果展现图
图2. Trim25 蛋白质二级结构预测分析