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茵陈质量标志物的预测(一)

来源:郑州天顺食品添加剂有限公司 发布时间:2021-09-22 09:31:29 关注: 0 次
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根据中药材品质标识物的核心理念,对茵陈成分实效性、招生数方式、成份非特异、传统式作用、传统式药效及成分可测性开展了潜在性品质标识物的预测分析.根据网络药理学开展成份实效性剖析,根据参考文献融合及数据统计分析对茵陈的招生数方式、成份非特异、传统式作用、传统式药效及成分可测性开展品质标识物预测分析.数据显示,网络药理学得到原儿茶醛、异鼠李素及茵陈黄酮类等13个活力成份,重要靶标有AKT1、TNF、JUN、MAPK1、RELA、TP53及IL6等.GO作用聚集剖析获得GO内容1 89两个,在其中微生物全过程内容1 64八个,细胞组成内容8两个,分子结构作用内容16两个.KEGG通道聚集挑选获得281条转录因子(P<0.05),涉及到癌病通道、乙肝及TNF转录因子等.结果显示,融合网络药理学和参考文献剖析得到了茵陈蒿灵A、马栗树根素二甲醚、大牛儿烯D、6,7-二叔丁基香豆素和茵陈色原酮可做为茵陈潜在性的品质标识物。

前言

茵陈为菊科绿色植物滨蒿或茵陈蒿的干躁地面上一部分,具备清热利湿退黄与清热去火的作用,关键适用于医治新生儿黄疸与尖锐湿疣等病症。茵陈的主要成分包含有机物类、黄酮类化合物、多糖类、香豆素类及桂皮醛类等.茵陈的当代药用价值有退热、止痛、抗感染、抗病毒治疗、抗癌、降血脂、调血糖、抗骨质疏松症、神经系统维护、调整新陈代谢及防止老年性痴呆病等各种作用。中药材品质标识物(Q-marker)是中药材质量管理的新理念,根据中药材传送与追溯、合理、独有、能测和药方搭配的“五标准”,可创建中药材全过程质量管理及品质追溯管理体系,为中药材质量管理给予了新的构思.文中根据Q-marker基础理论,应用网络药理学和参考文献剖析对茵陈潜在性Q-marker开展预测分析,为总体操纵茵陈的品质保证参照根据。

1数据库查询和专业软件

TCMSP数据库查询(http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php),Uniprot数据库查询(https://www.uniprot.org/),Gene Cards数据库查询(https://www.genecards.org),线上venn图(http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html),DAVID6.8.0数据库查询(https://david.ncifcrf.gov/),Omicshare数据库查询(http://ww.omicshare.com),STRING数据库查询(https://string-db.org/),Graph Pad Prism 6.0手机软件及Gytoscape 3.7.2手机软件等。

2方式与Q-marker预测分析

2.1根据网络药理学的茵陈成份实效性的Q-marker预测分析

2.1.1茵陈活力化学成分及靶标的挑选

应用中药材系统软件药学数据库查询和剖析服务平台TC-MSP,以“茵陈”为关键字开展成分检索,以内服溶出度(OB)≥30%和类药效(DL)≥0.18为挑选标准,开展茵陈活力化学成分的挑选,共获得13种活力成份(见表1)。与此同时,运用TCMSP数据库查询搜集茵陈活力化学成分的靶点蛋白质。依靠Uniprot数据库查询,将靶点蛋白质名字导进,种群限制为“Human”,查找获得的全部靶点蛋白质校准Uniprot ID,并获得靶点蛋白质所相对应的遗传基因名。

2.1.2相交遗传基因的挑选

茵陈的主冶病症为新生儿黄疸和皮肤湿疹.新生儿黄疸临床医学常见病有急慢性肝病、肝硬化腹水、胆囊结石及消化道肿瘤等.以黄疸型肝炎、慢性肝病、慢性乙型肝炎、肝硬化腹水、胆囊结石、消化道肿瘤和皮肤湿疹为病症,运用Gene Cards数据库查询搜索之上病症的遗传基因,挑选每一种病症的前300个遗传基因排序在一起,做为治疗药物的疾病基因,共得到疾病基因1 050个。运用线上venn图,将成份遗传基因和疾病基因导进,获得相交遗传基因共8一个,結果如图所示1所显示。

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