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茵陈质量标志物的预测(二)

来源:郑州天顺食品添加剂有限公司 发布时间:2021-09-19 13:48:28 关注: 0 次
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2.1.3 GO归类聚集剖析

将所取得的81个靶标导进STRING数据库查询开展GO作用聚集剖析,获得GO内容1 892个,在其中微生物全过程内容1 648个,细胞组成内容82个,分子结构作用内容162个,各自占73%、13%、14%.在其中,微生物全过程关键涉及到碳氢化合物新陈代谢全过程的正管控、生物大分子新陈代谢全过程的正管控、体细胞全过程的正管控、刺激性反映的调整、体细胞对有机化学成分的反映、体细胞对有机化学刺激性的化学反应及对含氧量化学物质的反映等全过程;分子结构作用关键涉及到激话转录因子融合、蛋白融合、酶融合及蛋白异构化活力等作用;细胞组成涉及到在膜融合体细胞器、细胞核部、胞外区及细胞结构等地区.3个支系总数排名前20位有关内容信息内容柱形图如图所示2所显示.

2.1.4 KEGG通道聚集剖析

运用DAVID6.8.0数据库查询对81个靶标开展通道聚集剖析,获得281条转录因子(P<0.05),涉及到癌病、乙肝和TNF转录因子等,说明这种靶标很有可能关键根据管控这种通道做到干涉病症的目地.前20位转录因子气泡图如图所示3所显示.

2.1.5“成份—靶标—通道”互联网搭建及剖析

将聚集剖析获得的排名前20的通道所相对应的57个功效靶标及13种成份,应用Cytoscape3.7.1手机软件搭建“成份—靶标—通道”互联网,依据网上的拓扑学特性度值排列明确关键节点,在所建立的互联网中,根据Degree值(度值)明确关键节点,度值>中位值(成示值中位值=3,靶标度值中位值=15,通道度值中位值=14)的成份有4种,靶标有28个,通道有10条.4种成份为原儿茶醛、异鼠李素、β-谷甾醇及茵陈蒿灵A,度值各自为55、8、7和5,因为该4种化学物质在网上中有着较高的连结度,提醒这可能是茵陈充分发挥药力的关键活力成份.靶标的关键节点分别是AKT1、TNF、JUN、MAPK1、RELA、TP53及IL6,度值分别是38、37、37、36、36、34及31,说明这可能是茵陈化学物质功效于癌病、恶性肿瘤、乙肝病毒与病毒感染等转录因子潜在性的主导作用靶标.网络药理学科学研究从成份实效性视角提醒原儿茶醛、异鼠李素、β-谷甾醇及茵陈蒿灵A等成份可做为茵陈潜在性Q-marker开展多方面科学研究.

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